Діагностика раку за позаклітинної днк

днк

Уздовж довжини ДНК утворюються структури у вигляді петель, звані нуклеосомами і пов`язані білками

Відео: транскриптомної дослідження раку - Антон Буздин

Вчені розробили новий аналіз крові, який може розширити сферу рідкої біопсії. 14.01.2016 р Новий підхід до рідкої біопсії може подолати обмеження існуючих аналізів крові для діагностики і моніторингу раку, вроджених дефектів, трансплантації органів і аутоімунних розладів. Метод заснований на аналізі закономірностей фрагментації ДНК в позаклітинному середовищі, а також у порівнянні їх з тим, що можна було б очікувати після загибелі клітин, пов`язаних з різними захворюваннями. Для деяких видів раку дослідники змогли визначити анатомічний джерело пухлини, що може допомогти в діагностиці метастатичного раку, походження якого було невідомо.

Уздовж довжини ДНК утворюються структури у вигляді петель, звані нуклеосомами і пов`язані білками. Коли клітини вмирають, ферменти (подібно до ножиць) розрізають ДНК шляхом охоплення легкодоступних ділянок між нуклеосомами і білками. Отримані сегменти ДНК дозволяють виявити, де були розташовані нуклеосоми і білки.

Відео: Пошук методів неінвазивної діагностики раку

Коли клітини вмирають, вони не зникають безслідно. Утворюється позаклітинна ДНК, крихітні фрагменти якої можуть бути знайдені в крові. В останні роки дослідження в області позаклітинної ДНК привели до тесту, який ще називають «рідкою біопсією». Завдяки цьому новому аналізу можна діагностувати і контролювати деякі види раку, виявляти аномалії плода, а також оцінювати стан здоров`я після пересадки органів. Незважаючи на багатообіцяючі перспективи, за допомогою цього аналізу можна виявити лише незначне число захворювань.

Новий метод розширює можливості рідкої біопсії

У новому дослідженні вчені показали, що можливо подолати багато обмежень, застосовуючи метод для виявлення, які саме типи клітин привели до утворення позаклітинної ДНК. Цей метод потенційно може розширити сферу рідкої біопсії. Новий підхід спирається на: 1) аналіз зразків фрагментації, які присутні в клітинній ДНК людини-2) порівняно цієї схеми з тим, що можна було б очікувати від загибелі клітин, пов`язаних з різними медичними або фізіологічних умовами.

Результати дослідження показали, що цілком можливо визначити тканину, з якої утворилася позаклітинна ДНК, якщо порівнювати її з моделями фрагментації (замість того, щоб шукати конкретні мутації в ДНК). У тесті аналізують кінці кожного фрагмента ДНК, а також намагаються визначити гарячі точки, або частини ДНК, які виходить вирізати частіше, ніж інші.

У ядрі клітини ДНК повинна бути спіральної і складена в неймовірно компактному корпусі. Ключем до цього процесу є структури, звані нуклеосоми, які складаються з білкового ядра, навколо якого намотана ДНК (як нитка навколо котушки). Нуклеосоми розтягнуті по всій довжині генома, як намистини на нитці. Кожен тип клітин в організмі упаковує ДНК трохи інакше. Ці відмінності залишають свій сигнал в разі утворення позаклітинної ДНК.

Відео: С.Н.Лазарев-Діагностика карми

Дослідники припустили, що можна з`ясувати, з якого виду тканин сталася позаклітинна ДНК. Щоб зробити це, потрібно спочатку дізнатися, які частини ДНК були обгорнуті навколо нуклеосом.

Під час загибелі клітин ферменти розрізають ДНК на дрібні шматочки в легкодоступних, незахищених ділянках ДНК між нуклеосомами. Дослідження вказали на 13 млн позицій в геномі людини, де, швидше за все, будуть розташовані нуклеосоми.

Різні види раку залишають різну позаклітинне ДНК

Використовуючи зразки крові у хворих на рак, дослідники показали, що різні види раку залишають різні позаклітинні ДНК. Для деяких видів раку вченим вдалося визначити анатомічний джерело пухлини.

Це може бути особливо актуально при метастатичному раку, коли невідомий джерело пухлини. Таким чином, цей аналіз може допомогти в діагностиці виду раку, що необхідно для адекватного лікування.

У більшості випадків вчені, застосовуючи рідку біопсію, починають шукати невідповідності між різними ДНК в організмі (як мутації, знайдені в пухлинних клітинах, але не в здорових клітинах). Дослідники вважають, що перевагою нового тесту є те, що він може працювати, навіть якщо клітки генетично ідентичні один одному.

Відео: Нові методи лікування раку у Великобританії

Цей підхід потенційно може бути використаний для діагностики різних захворювань, при яких клітини вже загинули, але ще не можуть бути діагностовані за допомогою рідкої біопсії. Позаклітинне ДНК можна застосовувати для діагностики локалізації раку, серцевого нападу, інсульту і аутоімунних захворювань. джерело: Університет Вашингтона медичних наук


Поділися в соц мережах:

Увага, тільки СЬОГОДНІ!
Cхоже
Увага, тільки СЬОГОДНІ!